Elle a été élue à la tête du diocèse d'Holstein-Lübeck de l'Eglise évangélique luthérienne du nord de l'Elbe. Après son élection, elle a exprimé l'espoir que sa nomination encouragera ceux qui aspirent à "un renouveau des relations entre femmes et hommes."

Barbel Wartenberg-Potter a précisé qu'elle comptait, entre autres priorités, contribuer au renouvellement de la liturgie de l'Eglise en s'inspirant de son expérience du mouvement oecuménique, et aider l'Eglise à s'exprimer sur des questions telles que la mondialisation, l'intégration des étrangers, l'environnement et l'économie.